Estimación del tamaño del genoma nuclear de tres especies de algas verdes (Chlorophyta)

Abstract

Las microalgas son un grupo de microorganismos de mucho interés por su alto contenido de moléculas bioactivas y nutracéuticas. Sin embargo, los aspectos genéticos moleculares y bioquímicos de la producción de estas moléculas son muy limitados. Para contribuir a establecer las bases moleculares de estos microorganismos, el objetivo de este estudio fue estimar el tamaño de los genomas de las microalgas Ankistrodesmus sp., Haematococcus pluvialis y Scenedesmus sp. El ADN genómico se purifició y analizó mediante métodos estándares. Posteriormente, los genomas fueron secuenciados con la tecnología de secuenciamiento masivo de Illumina y se estimó los tamaños de sus genomas con la herramienta bioinformática Jellyfish. Los resultados muestran que se obtuvo ADN genómico de alta pureza y calidad. Asimismo, con las secuencias de los genomas se ha generado abundante información genética de 7,84 a 10,46 Gb. También, los tamaños de los genomas estimados fueron de 62,53 Mb para Ankistrodesmus sp., 75,23 para Haematococcus pluvialis y de 120,41 Mb para Scenedesmus sp. En conclusión, el ADN genómico purificado de las tres especies de microalgas fue de alta calidad, este fue secuenciado exitosamente y los tamaños de sus genomas variaron en el rango de tamaños reportados para otras especies de microalgas.

Microalgae are a group of microorganisms of great interest, because of their high content of bioactive and nutraceutical molecules. However, the molecular genetic and biochemical aspects of the production of these molecules are very limited. To improve the molecular basis of these microorganisms, the objective of this study was to estimate the size of the genomes of the microalgae Ankistrodesmus sp., Haematococcus pluvialis and Scenedesmus sp. Genomic DNA was purified and analyzed by standard methods. Subsequently, genomes were sequenced using Illumina's massive sequencing technology and genome sizes were estimated using the Jellyfish bioinformatic tool. The results show that genomic DNA of high purity and quality was obtained. In addition, genomic sequences have generated abundant genetic information from 7.84 to 10.46 Gb. Also, the estimated genome sizes were 62.53 Mb for Ankistrodesmus sp., 75.23 for Haematococcus pluvialis and of 120.41 Mb for Scenedesmus sp. In conclusion, the genomic DNA purified from the three species of microalgae was of high quality, this was successfully sequenced and the sizes varied in the size range reported for other microalgae species.